Testowanie funkcjonalne systemu polega na wykonaniu testów, które umożliwiają dokonanie oceny funkcji, jakie system ten powinien realizować. Wymagania funkcjonalne mogą być opisane w produktach pracy takich jak: specyfikacje wymagań biznesowych, opowieści, historyjki użytkownika, przypadki użycia lub specyfikacje funkcjonalne, ale zdarza się również, że występują one w postaci nieudokumentowanej. Funkcje opisują to, „co” powinien robić dany system.

Testy funkcjonalne należy wykonywać na wszystkich poziomach testów (np. testy dotyczące modułów mogą opierać się na specyfikacjach modułów), jednakże z zastrzeżeniem, że testy wykonywane na poszczególnych poziomach skupiają się na różnych zagadnieniach (patrz podrozdział 2.2.).

Testowanie funkcjonalne uwzględnia zachowanie oprogramowania, w związku z czym do wyprowadzania warunków testowych i przypadków testowych dotyczących funkcjonalności komponentu lub systemu można używać technik czarnoskrzynkowych (patrz podrozdział 4.2.).

Staranność testowania funkcjonalnego można zmierzyć na podstawie pokrycia funkcjonalnego. Termin „pokrycie funkcjonalne” oznacza stopień, w jakim został przetestowany określony typ elementu funkcjonalnego, wyrażony jako procent elementów danego typu pokrytych przez testy. Dzięki możliwości śledzenia powiązań między testami a wymaganiami funkcjonalnymi można na przykład obliczyć, jaki procent wymagań został uwzględniony w ramach testowania, a w rezultacie zidentyfikować ewentualne luki w pokryciu.

Do projektowania i wykonywania testów funkcjonalnych mogą być potrzebne specjalne umiejętności lub specjalna wiedza taka jak znajomość konkretnego problemu biznesowego rozwiązywanego przy pomocy danego oprogramowana (np. oprogramowania do modelowania geologicznego dla przemysłu naftowego i gazowego) bądź konkretnej roli, jaką spełnia dane oprogramowanie (np. gra komputerowa zapewniająca interaktywną rozrywkę).